Projektmanagement im Softwarebereich - OpenMS
In diesem Praktikum werden Algorithmen zur Analyse von Massenspektrometrie Daten implementiert, und zwar im Rahmen der Software-Bibliothek OpenMS, die zur Zeit in unserer Arbeitsgruppe entwickelt wird. Mithilfe der zu implementierenden Module werden komplexe Analyse-Pipelines für Proteom/Metabolom Daten in KNIME realisiert.
Gute Kenntnisse in C/C++ werden vorausgesetzt.
(19403413)
| Type | Softwarepraktikum |
|---|---|
| Instructor | Sandro Andreotti, Chris Bielow |
| Registration Mode | Die Praktikumsplätze werden über ein besonderes Anmeldeverfahren vergeben. Beachten Sie dazu die Hinweise auf der Webseite des Studienbüros zum Softwarepraktikum. |
Allgemein
Zu den unten genannten Terminen (Tutorialwoche und Vorträge) gibt es eine Anwesenheitspflicht. Die Ausarbeitung des Projektplans und die Bearbeitung der Projekte erfolgt dann selbständig in freier Arbeit mit Unterstützung des Betreuers.
Während dieser Zeit sollten sich die Teilnehmer regelmäßig/wöchentlich mit ihrem Betreuer treffen.
Voraussetzungen
- Erfahrung in ObjektorienPerter Programmierung (Java, C++, ...)
- C++ Kenntnisse empfehlenswert (keine Templates)
-
R Grundwissen (ggplot2) empfehlenswert
Zeitplan
| Datum | Termin/Dauer | Ort | Inhalt |
| 1.3. | 10 -12 | T9 / 055 | Vorbesprechung |
| 20.3. - 24.3. | 9 - 12 | A6 / SR-007 | Tutorials |
| ... | ... | ... | Ausarbeitung der Projektpläne (selbstständig) |
| 5.4. | 9 - 12 | T9 / 053 | Vorstellung der Projektpläne |
| 7.4. - 5.5. | Freitags 10 - 12 |
T9 / 005 (7.4. - 14.4.) T9 / 006 (21.4. - 5.5.) |
Wöchentliche Treffen begleitend zur selbstständigen Programmierarbeit und Anfertigung des Berichts |
| 12.5. | 9 - 18 | T9 / K40 | Vorstellung der Ergebnisse |
Ressourcen
Projektvorstellung
- Ein Überblick zum Inhalt Veranstaltung wird in dieser Präsentation gegeben.
C++
OpenMS
KNIME