Projektmanagement im Softwarebereich - OpenMS
In diesem Praktikum werden Algorithmen zur Analyse von Massenspektrometrie Daten implementiert, und zwar im Rahmen der Software-Bibliothek OpenMS, die zur Zeit in unserer Arbeitsgruppe entwickelt wird. Mithilfe der zu implementierenden Module werden komplexe Analyse-Pipelines für Proteom/Metabolom Daten in KNIME realisiert.
Gute Kenntnisse in C/C++ werden vorausgesetzt.
(19403413)
| Type | Softwarepraktikum |
|---|---|
| Instructor | Chris Bielow, Sandro Andreotti |
| Registration Mode | Die Praktikumsplätze werden über ein besonderes Anmeldeverfahren vergeben. Beachten Sie dazu die Hinweise auf der Webseite des Studienbüros zum Softwarepraktikum. |
Allgemein
Zu den unten genannten Terminen (Tutorialwoche und Vorträge) gibt es eine Anwesenheitspflicht. Die Ausarbeitung des Projektplans und die Bearbeitung der Projekte erfolgt dann in selbständiger Arbeit mit Unterstützung des Betreuers.
Während dieser Zeit treffen sich die Teilnehmer regelmäßig/wöchentlich mit ihrem Betreuer.
Voraussetzungen
- Erfahrung in objektorientierter Programmierung (Java, C++, ...)
- C++ Kenntnisse empfehlenswert (wenig Templates)
-
R Grundwissen (ggplot2 etc) empfehlenswert
Zeitplan
| Datum | Termin/Dauer | Ort | Inhalt |
| 1.3. | 10 -12 | tbd | Vorbesprechung (Zeitpunkt flexibel verschiebbar +-2 Wochen) |
| 19.3. - 23.3. | 9 - 12 | tbd | Tutorials |
| ... | ... | ... | Ausarbeitung der Projektpläne (selbstständig) |
| 29.3. | 9 - 12 | tbd | Vorstellung der Projektpläne |
| 13.4. - 11.5. | Freitags 10 - 12 |
tbd |
Wöchentliche Treffen begleitend zur selbstständigen Programmierarbeit und Anfertigung des Berichts |
| 18.5. | 9 - 12 | tbd | Vorstellung der Ergebnisse |
Ressourcen
Projektvorstellung
- Projektvorstellung vom 2.2. als PDF / PowerPoint.
C++
OpenMS
KNIME